Python 如何执行卡方拟合度检验

Python 如何执行卡方拟合度检验

Data Scientists经常使用统计方法进行假设检验,以从数据集中获取洞察。虽然有多种统计方法可用,但本文将讨论卡方拟合度检验及其在Python中的实现。卡方检验验证了分类变量的观察分布与预期分布是否一致。它告诉我们可用事件值是否与预期值不同。

卡方检验

您可以执行卡方检验来验证观察事件的数据集分布。卡方检验有一些假设,如下所示:

  • 变量是独立的。
  • 只存在一个分类特征。
  • 每个变量必须包含具有超过五个频率计数的类别。
  • 随机抽样的数据集。
  • 每个数据组的频率计数必须显示互斥性。

卡方检验统计量

卡方检验使用以下公式给出统计输出:

Python 如何执行卡方拟合度检验

其中

  • v表示自由度
  • O表示样本观察值
  • E表示总体预期值
  • n表示变量类别计数

现在让我们学习如何执行卡方检验。

假设检验步骤

执行卡方检验有几个步骤,如下所示:

  • 首先,需要创建一个原假设H0和一个备择假设H1。
  • 然后,需要决定接受或拒绝原假设的概率阈值。通常情况下,该阈值的值为5%,相应的临界值取决于分布。
  • 然后,使用上述公式计算卡方统计量。
  • 最后,比较检验统计值与临界值。如果检验统计量大于临界值,则拒绝原假设;否则,无法拒绝原假设。

让我们使用上述步骤来实现测试。

在这里,原假设是变量按预定方式分布。备择假设是变量分布不同。我们将使用两种方法实现卡方检验,如下所述:

使用内置函数实现卡方检验

语法

chi_square_test_statistic, p_value = stats.chisquare(
    experience_in_years, Salary)

这个函数接受两个特征,对它们应用卡方公式,并返回卡方检验统计量和p值。

步骤

  • 加载所需的依赖项,如scipy和numpy

  • 将要应用测试统计量的特征传递给scipy.stats的卡方函数。

  • 获取测试统计量和p值。

  • 根据p值和卡方统计量接受或拒绝零假设和备择假设。

示例

该过程从加载所有必要的依赖项开始。

# importing packages
import scipy.stats as stats
import numpy as np

让我们准备一个演示数据,其中包括两列“经验年限”和“薪水”。对于这些数据,我们将进行卡方检验。

# No of years of experience of an employee
# Yearly Salary package in lakhs

experience_in_years= [8, 6, 10, 7, 8, 11, 9]
Salary= [9, 8, 11, 8, 10, 7, 6]

# Chi-Square Goodness of Fit Test
chi_square_test_statistic, p_value = stats.chisquare(
    experience_in_years, Salary)

# chi square test statistic and p value
print('chi_square_test_statistic is : ' +
    str(chi_square_test_statistic))
print('p_value : ' + str(p_value))

# find Chi-Square critical value
print(stats.chi2.ppf(1-0.05, df=6))

解释

上述代码是使用Scipy库中的内置函数实现的Chi-Square检验的Python实现。从stats中导入了chisquare方法,它返回两个值:卡方检验统计量和p值。该方法接受两个特征,并将比较两个变量,并应用上述卡方公式来计算卡方统计量。在这里,我们比较了工作经验年限和年薪之间的关系。

输出

chi_square_test_statistic is : 5.0127344877344875
p_value : 0.542180861413329
12.591587243743977

正如我们在这里可以看到的那样,p值为0.54,临界值为12.59。检验统计量小于临界值,因此我们可以接受原假设并拒绝备择假设。

从头开始实施卡方检验

语法

chi_square_test_statistic1 = chi_square_test_statistic1 + \
   (np.square(experience_in_years[i]-salary[i]))/salary[i]

使用上述公式计算数据集中每个样本的卡方值,并将它们加在一起得到最终得分。

步骤

  • 加载所需的依赖项,如numpy。

  • 用值为0的变量初始化,该变量将存储统计量的最终值。

  • 对数据中的每个样本进行迭代,计算每个样本的统计量,并将其添加到包含统计量最终值的变量中。

  • 一旦计算出统计量,接受或拒绝零假设和备择假设。

示例

该方法将使用公式实现卡方适合度检验。这种方法将产生与上述方法相同的结果。

import scipy.stats as stats
import numpy as np

# No of years of experience of an employee
# Yearly Salary package in lakhs 
experience_in_years= [8, 6, 10, 7, 8, 11, 9]
salary= [9, 8, 11, 8, 10, 7, 6]

# determining chi square goodness of fit using formula
chi_square_test_statistic1 = 0
for i in range(len(experience_in_years)):
    chi_square_test_statistic1 = chi_square_test_statistic1 + \
        (np.square(experience_in_years[i]-salary[i]))/salary[i]

print('chi square value determined by formula : ' +
    str(chi_square_test_statistic1))

# find Chi-Square critical value
print(stats.chi2.ppf(1-0.05, df=6))

解释

上述代码已在Python中实现,用于对相同数据进行卡方检验。在此方法中,我们只使用Python实现了卡方统计公式,而没有导入内置方法。for循环帮助迭代数据集。然后,我们使用NumPy实现了上述公式,并将分数与以前的分数相加,以获得整个数据集的总分。最后,我们检查使用此方法得到的卡方统计。

输出

chi square value determined by formula : 5.0127344877344875
12.591587243743977

正如我们所预期的那样,结果与我们使用上一方法得到的结果相同。这个结果还表明我们不应拒绝零假设,但我们可以拒绝备择假设。

结论

我们学习了卡方拟合优度检验以及如何使用Python实施它。让我们用以下几个关键要点总结本文:

  • 卡方检验验证了观察到的分类变量与期望变量分布的一致性。

  • 卡方检验有一些假设,包括只有一个分类变量、独立变量、至少五个唯一类别和随机抽样的数据。

  • 我们通过接受或拒绝零假设来得出检验结果。

  • 阈值必须小于临界值才能接受零假设。

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