Python 根据bsub的obid列表循环检测所有jobid任务是否运行完成

Python 根据bsub的obid列表循环检测所有jobid任务是否运行完成

在使用bsub命令提交任务时，我们可以通过obid参数获取到每个任务的唯一标识jobid。有时候我们需要监测这些任务是否已经完成，以便进行后续操作。本文将介绍如何使用Python根据bsub的obid列表循环检测所有jobid任务是否运行完成的方法。

1. 获取任务obid列表

首先，我们需要获取到所有任务的obid列表。假设我们已经通过bsub提交了一批任务，并将它们的obid保存在一个列表中：

obid_list = [10, 20, 30, 40, 50]

2. 循环检测任务是否完成

接下来，我们可以编写一个函数，用于检测指定的jobid任务是否已经完成。我们可以使用bjobs命令来查询任务的状态，如果任务已经完成，则返回True；否则返回False。

import os

def check_job_completion(jobid):
    status = os.popen(f"bjobs -l {jobid}").read()
    if "Done" in status:
        return True
    else:
        return False

3. 循环遍历obid列表

接着，我们可以编写一个循环，遍历obid列表，逐个检测任务的完成状态。如果任务完成则输出相应信息，否则输出任务还在运行。

for obid in obid_list:
    if check_job_completion(obid):
        print(f"Job {obid} has completed.")
    else:
        print(f"Job {obid} is still running.")

4. 完整代码

下面是完整的Python代码：

import os

obid_list = [10, 20, 30, 40, 50]

def check_job_completion(jobid):
    status = os.popen(f"bjobs -l {jobid}").read()
    if "Done" in status:
        return True
    else:
        return False

for obid in obid_list:
    if check_job_completion(obid):
        print(f"Job {obid} has completed.")
    else:
        print(f"Job {obid} is still running.")

5. 运行结果示例

假设obid列表中的任务都已经完成，运行以上代码将得到如下输出：

Job 10 has completed.
Job 20 has completed.
Job 30 has completed.
Job 40 has completed.
Job 50 has completed.

结语

通过以上方法，我们可以很方便地使用Python根据bsub的obid列表循环检测所有jobid任务是否运行完成。