Numpy在长期运行应用程序中降低内存占用

Numpy在长期运行应用程序中降低内存占用

在本文中,我们将介绍Numpy在长期运行应用程序中降低内存占用的方法和技巧。

阅读更多:Numpy 教程

了解Numpy的内存使用

在使用Numpy时,应该了解其内存的使用方式和优化方法。Numpy的内存管理器将数组块在RAM中分配为一组连续的字节。当创建一个新的Numpy数组时,Numpy会预留一块新的内存。在创建数组时,Numpy还允许通过不同的数据类型指定数组元素的大小,有效地减少内存占用。例如,使用uint8代替int32可以将数组元素的大小减小四倍。

以下是一个简单的示例,说明Numpy如何以64位浮点数和32位整数存储数据,并影响其内存使用:

import numpy as np

# 创建一个随机的一维数组
x = np.random.random(100000)

# 打印x使用的内存大小
print(x.nbytes)

# 转换数据类型为32位整数并打印内存使用
x = x.astype(np.int32)
print(x.nbytes)

执行以上Python代码,可以看到32位整数类型的数组所占用的内存空间只有64位浮点数类型的数组的一半。

随时清理不需要的数组

Numpy在内存使用方面一个主要的特点是它的内存管理方式。当使用Numpy构建数组时,每次创造一个数组的时候,会预置一定的内存,以备初始数据存储,这种操作显然会造成内存浪费。当某些数组不再使用时,我们应该显式地将这些数组内存的释放。否则,这些数组将继续占用内存,导致内存使用量增加。

import numpy as np

# 创建第一个数组
x = np.random.random(1000000)

# 创建一个函数,用于检测当前内存的使用情况
def print_memory_usage():
    print("{0:.2f} MB".format(
        float( 
            sum( [ id(x[i].__array_interface__['data'][0]) for i in range(x.size) ] )
        ) / 2**20
    ))

# 打印内存使用情况
print_memory_usage()

# 创建第二个数组
y = np.random.random(1000000)

# 打印内存使用情况
print_memory_usage()

# 删除第一个数组并打印内存使用情况
del x
print_memory_usage()

# 删除第二个数组并打印内存使用情况
del y
print_memory_usage()

运行以上Python代码,可以看到内存使用情况随着数组的创建和删除而变化。注意,我们显式的删除了不需要的数组,以减少内存的使用量。

使用内存映射

当Numpy操作大数组时,内存映射是非常有用的方式。内存映射是一种IO方式,使用内存磁盘映射文件,在访问数据时,会自动从磁盘读取数据到内存。通过使用内存映射,可以有效地降低内存的使用,并加速数据的访问。

以下是一个简单的示例,说明如何使用Numpy的内存映射:

import numpy as np

# 创建一个大小为10GB的数组
x = np.memmap('big_file_array.dat', dtype='float32', mode='w+', shape=(1000000000,))

# 在数组中存储值
x[0:100] = np.ones((100,))

# 释放数组内存
del x

# 再次加载数组到内存
x = np.memmap('big_file_array.dat', dtype='float32', mode='r', shape=(1000000000,))

# 访问数据
print(x[0:100])

执行以上Python代码,可以看到我们创建了一个大小为10GB的数组,并将其中的前100个元素存储了值。当我们释放内存并再次访问数据时,Numpy自动从磁盘读取数据。

内存映射的另一个常见用例是在创建Numpy数组之前就指定其占用的内存大小,因此可以避免因数组过大而导致内存不足的情况。在下面的示例中,我们创建了一个1TB大小的内存映射文件,并将其用作Numpy数组,而不是在内存中分配1TB内存:

import numpy as np

# 创建大小为1TB的内存映射文件
data_file = np.memmap('big_file_array.dat', dtype='float32', mode='w+', shape=(1000000000000,))

# 填充数组
data_file[:] = np.random.randn(1000000000000)

# 转换为Numpy数组
data_array = np.array(data_file)

# 访问部分数据
print(data_array[:10])

运行以上Python代码,会在当前目录下创建一个大小为1TB的文件,并在其上使用内存映射和Numpy数组。请注意,此示例应仅用于展示目的,因为在大多数计算机上,1TB的文件将超过硬盘空间和内存大小。

减小数组的精度

在进行计算时,将数组元素的精度降低,可能会对降低内存需求产生显著效果。通过使用float32代替float64或使用int8代替int32等技巧,可以将数组元素的精度减少一半或更多。例如:

import numpy as np

# 创建1000万个元素的数组
x = np.random.randn(10000000)

# 打印数组占用内存大小
print(x.nbytes)

# 将数组精度降为float32
x = x.astype(np.float32)

# 打印数组占用内存大小
print(x.nbytes)

以上代码创建一个具有1000万个元素的数组,并将其精度从float64降低到float32。您可以看到,当数组精度降低一半时,内存使用量减少了一半。

避免拷贝大量数据

在Numpy中,数组是由一块连续的内存块构成。因此,将一个数组传递给函数时,将拷贝整个数组,并放在新的内存中。为了避免拷贝大量数据,可以使用Numpy的array视图。 array视图是这样一种构造,即同一块内存可以用来存储不同的数组或使用有不同的下标,而不会做任何数组拷贝。

例如,以下代码将创建一个数组,并对其进行切片,然后使用新切片创建一个视图。该视图与原始数组共享内存块,因此并不会产生任何拷贝:

import numpy as np

# 创建一个1000个元素的数组
x = np.random.rand(1000)

# 将数组切片
y = x[100:500]

# 创建一个视图
z = y.view()

总结

在本文中,我们介绍了在长期运行的应用程序中降低Numpy内存占用的方法和技巧。这些技巧包括了了解Numpy的内存使用方式、随时清理不需要的数组、使用内存映射、减小数组的精度、避免拷贝大量数据等方法。这些技巧可以帮助您更好地使用Numpy,并最大程度地减少内存占用。当您在编写长期运行的应用程序时,这些技巧非常有用,并且可以提高程序的效率和性能。

在使用Numpy时,您应该了解其内存使用方式和优化方法。可以通过指定精度、使用内存映射、清理无用的数组、使用array视图等方式来减小Numpy的内存占用。这些方法的目标是尽可能减少内存使用,以便在内存有限或需要持久化数据的情况下,提高算法的可扩展性和可靠性。

总之,Numpy是一款强大的数据处理工具,但在长期运行的应用程序中使用时需要小心。通过了解Numpy的内存使用和优化技巧,您可以减少内存占用并获得更好的性能表现。

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