Numpy memmap介绍

Numpy memmap介绍

Numpy和memmap

首先,我们需要了解Numpy和memmap。Numpy是一个Python库,提供多维数组对象、各种派生对象(如掩码数组和矩阵),以及用于数组操作的各种函数。在Numpy中,数组数据是指针指向一个内存块,因此可以操作大型数据集。

而memmap是一个Numpy数组的子类,它将数组数据保存在磁盘上而不是内存中。它允许我们加载大型数组,而不必尝试将它们全部保存在内存中,从而避免了内存不足的问题。

在使用memmap之前,我们需要做一些准备工作:

import numpy as np
filename = 'test.dat'
shape = (1000, 1000)

此处,我们定义了一个1000*1000的矩阵和要保存的文件名。

接下来,我们创建一个memmap:

mmap = np.memmap(filename, dtype='float32', mode='w+', shape=shape)

此处,我们使用Numpy的memmap函数创建了一个名为test.dat的文件,并在其中创建了一个1000*1000的浮点数数组。我们指定了数组的dtype(数据类型)和mode(文件访问模式)。

现在,我们可以像使用普通数组一样使用memmap数组。例如,我们可以给它赋值:

mmap[0, :] = np.random.rand(1000)

此处,我们将第一行设为随机数。

现在,我们需要将memmap对象刷新并关闭:

mmap.flush()
del mmap

阅读更多:Numpy 教程

Pandas Series

接下来,让我们来了解一下Pandas Series。它是一种类似于一维数组的数据结构,可以存储任意类型的数据(整数、浮点数、字符串等)。每个元素都有一个索引,可以是整数或标签。Pandas Series是Pandas库的一个组件,是基于Numpy数组的。

创建Pandas Series非常简单。我们只需要传递一个数组和一个可选的索引:

import pandas as pd
data = np.array([1, 2, 3, 4])
s = pd.Series(data, index=['a', 'b', 'c', 'd'])

这将创建一个名为s的Pandas Series,其中包含数据[1, 2, 3, 4]和索引[a, b, c, d]。我们可以像访问Numpy数组一样操作它:

print(s[0])  # 1
print(s['a'])  # 1

Pandas DataFrame

现在让我们来看看Pandas DataFrame。它是Pandas库中的另一种数据结构,可以看作是一个多维数组,行和列都有标签。每列可以存储不同的数据类型(整数、浮点数、字符串等),就像字典一样。

我们可以从以下方式之一创建DataFrame:

  • 从Numpy数组创建
  • 从Python字典创建
  • 从外部文件读取

现在我们来看看如何从Numpy数组创建DataFrame。让我们创建一个3*3的数组:

data = np.array([[1, 2, 3], [4, 5, 6], [7, 8, 9]])

我们可以将其转换为DataFrame:

df = pd.DataFrame(data, index=['row1', 'row2', 'row3'], columns=['col1', 'col2', 'col3'])

这将创建一个名为df的DataFrame,其中包含数据[[1, 2, 3], [4, 5, 6], [7, 8, 9]]和行名为row1、row2和row3,列名为col1、col2和col3。我们可以像访问字典一样访问列:

print(df['col1'])  # row1    1
                  row2    4
row3    7
Name: col1, dtype: int64

注意到DataFrame输出了每一行的索引和对应列的值。

我们还可以按照行和列的标签选择元素。例如,我们可以选择第一行和第一列的元素:

print(df.loc['row1', 'col1'])  # 1

我们还可以通过添加一个新列来向DataFrame添加数据:

df['col4'] = ['a', 'b', 'c']

这将创建一个名为col4的列,并将其添加到DataFrame中。我们可以像使用其他列一样使用它:

print(df['col4'])  # row1    a
                   # row2    b
                   # row3    c
                   # Name: col4, dtype: object

可以注意到,col4列的数据类型被设置为object。这是因为它包含了字符串类型的数据。

我们还可以从外部文件中读取数据,并创建DataFrame。例如,我们可以从CSV文件中读取数据:

data_file = 'data.csv'
df = pd.read_csv(data_file)

这将读取名为data.csv的文件,并创建一个DataFrame对象。

总结

在本文中,我们了解了Numpy和memmap、Pandas Series以及Pandas DataFrame的基本知识。我们学习了如何使用这些结构来管理大型数据集,以及如何将它们保存到磁盘上。我们还学习了如何创建DataFrame,然后使用它来操作数据。在数据科学中,这些知识是非常重要的,因为它们可以帮助我们处理大型数据、进行数据分析和建模。

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