Bokeh 在 IPython Notebook 中绘制大数据集的方法

Bokeh 在 IPython Notebook 中绘制大数据集的方法

在本文中,我们将介绍如何在 IPython Notebook 中使用 Bokeh 库来绘制和展示大数据集的图形。Bokeh 是一个用于创建交互式图形的 Python 库,它可以帮助我们轻松地绘制和探索大规模的数据集。

阅读更多:Bokeh 教程

什么是 Bokeh?

Bokeh 是一个用于构建漂亮、交互式、可视化的 Python 库。它提供了多种绘图选项,可以满足不同需求。Bokeh 可以用于快速、轻松地绘制各种类型的图形,包括散点图、线图、条形图等。与其他库相比,Bokeh 的一个独特之处在于它可以与 IPython Notebook 配合使用,实现交互式可视化。

安装 Bokeh

在开始之前,我们首先需要安装 Bokeh。可以使用以下命令来安装:

!pip install bokeh

安装完成后,我们可以导入 Bokeh 并开始使用。

import bokeh

创建 Bokeh 图形

绘制 Bokeh 图形的第一步是创建一个图形对象。我们可以通过调用 bokeh.plotting.figure 函数来创建一个新的图形对象。例如,我们可以创建一个简单的散点图,如下所示:

from bokeh.plotting import figure, show

# 创建一个新的图形对象
p = figure()

# 添加散点图数据
p.circle([1, 2, 3, 4, 5], [6, 7, 2, 4, 5], size=20)

# 显示图形
show(p)

上述代码将创建一个包含五个点的散点图,并将其显示在 IPython Notebook 中。

绘制大数据集

在处理大数据集时,Bokeh 提供了一些特定的技术来提高绘图性能和效率。下面是几种绘制大数据集的常用方法:

使用采样数据绘图

如果数据集非常大,则可以考虑使用采样数据进行绘图。这样可以减少点的数量,从而提高绘图的性能。下面是一个简单的例子:

from bokeh.plotting import figure, show
import numpy as np

# 创建一个新的图形对象
p = figure()

# 创建一个包含100个点的随机数据集
x = np.random.randint(0, 100, 100)
y = np.random.randint(0, 100, 100)

# 从数据集中采样10个点
sampled_x = x[::10]
sampled_y = y[::10]

# 添加采样数据的散点图
p.circle(sampled_x, sampled_y, size=10)

# 显示图形
show(p)

上述代码通过从包含100个点的数据集中采样10个点的方式,绘制了一个包含10个点的散点图。

使用直方图绘图

如果数据集包含大量数据点,则可以考虑使用直方图。通过将数据划分为不同的区间,我们可以将数据可视化为柱状图。下面是一个简单的例子:

from bokeh.plotting import figure, show
import numpy as np

# 创建一个新的图形对象
p = figure()

# 创建一个包含10000个点的随机数据集
x = np.random.normal(0, 1, 10000)

# 计算直方图
hist, edges = np.histogram(x, bins=30)

# 添加直方图
p.quad(top=hist, bottom=0, left=edges[:-1], right=edges[1:], fill_color="blue")

# 显示图形
show(p)

上述代码将随机生成的10000个点分为30个区间,并将它们绘制成柱状图。

使用数据聚合绘图

对于包含很多重复数据的大数据集,为了提高绘图性能,可以考虑使用数据聚合。Bokeh 提供了几个聚合函数,可以将重复的数据点合并成一个点。下面是一个简单的例子:

from bokeh.plotting import figure, show
import pandas as pd

# 创建一个新的图形对象
p = figure()

# 创建一个包含重复数据的数据集
data = pd.DataFrame({'x': [1, 2, 2, 3, 3, 3, 4, 5, 5, 5], 'y': [1, 2, 2, 3, 3, 3, 4, 5, 5, 5]})

# 使用数据聚合绘图
p.circle(x='x', y='y', size=20, source=data.groupby(['x', 'y']).size().reset_index(name='count').rename(columns={'count': 'size'}))

# 显示图形
show(p)

上述代码将重复的数据点合并成一个点,并将其绘制成散点图。

总结

本文介绍了如何在 IPython Notebook 中使用 Bokeh 绘制和展示大数据集的图形。我们学习了如何安装和导入 Bokeh,如何创建 Bokeh 图形对象,以及如何通过采样数据、直方图和数据聚合等技术绘制大数据集。Bokeh 提供了一种高效、易用的方式来处理和展示大规模的数据集,并提供了一系列丰富的绘图选项。

希望本文对您在 IPython Notebook 中处理大数据集的图形绘制有所帮助!

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